Der Verwaltungsrat ist das Organ des Evangelischen Kirchenkreisverbandes Meiningen in dessen Trägerschaft sich das Kreiskirchenamt befindet. Der Verwaltungsrat trägt die Verantwortung für die Arbeit des Kreiskirchenamtes und beschließt u. a. den Stellenplan und Haushaltsplan.
Dem Kirchenkreisverband gehören die Kirchenkreise Bad Salzungen-Dermbach, Rudolstadt-Saalfeld und Südthüringen an. Vorsitzender des Verwaltungsrates ist Herr Superintendent Michael Wegner, Kirchenkreis Südthüringen. Stellvertretender Vorsitzender ist Herr Superintendent Christoph Ernst, Kirchenkreis Bad Salzungen- Dermbach.