Der Verwaltungsrat ist das Organ des Evangelischen Kirchenkreisverbandes Meiningen in dessen Trägerschaft sich das Kreiskirchenamt befindet. Der Verwaltungsrat trägt die Verantwortung für die Arbeit des Kreiskirchenamtes und beschließt u. a. den Stellenplan und Haushaltsplan.
Dem Kirchenkreisverband gehören die Kirchenkreise Arnstadt-Ilmenau, Bad Salzungen-Dermbach, Hildburghausen-Eisfeld, Meiningen, Rudolstadt-Saalfeld und Sonneberg an. Vorsitzende des Verwaltungsrates ist Frau Superintendentin Beate Marwede, Kirchenkreis Meiningen. Stellvertreter ist Herr Superintendent Michael Wegner, Kirchenkreis Rudolstadt-Saalfeld.